航道整治建筑物在长江上游广泛存在，其在改变局部河段的水动力和水体理化特征的同时也会对浮游生物群落产生重要的影响。于寸滩站11 000 m3/s流量下开展顺坝和丁坝2座航道整治建筑物的水动力、水质及浮游生物生物量现场监测，利用MIKE21软件建立流场，进一步模拟不同流量下坝体前后水动力、水质、生物量的变化趋势。监测结果表明，相较于坝前，两坝体坝后流速减小，溶解氧浓度、浮游植物密度、生物量增加，其中顺坝和丁坝浮游植物密度分别增加69.39%和62.18%，生物量分别增加77.42%和56.41%。基于现场监测数据建立模型得出，4 500、11 000、39 200 m3/s流量下航道整治建筑物前后水动力、水质及生物量差异性逐渐降低，4 500 m3/s流量下整治建筑物生态效果最好。研究成果可为航道整治工程区生物的保护和生态航道的建设提供理论依据。